Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms