Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms