Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms