Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms