Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VGLL1Q99990 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms