Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP9

GFM1, Elongation factor G, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFM1Q96RP9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFM1Q96RP9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms