Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDAQ92838 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms