Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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