Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms