Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTOP1Q7RTM1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms