Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPTE2Q6XPS3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms