Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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