Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms