Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF220Q5VTB9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF220Q5VTB9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms