Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms