Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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