Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms