Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms