Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms