Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms