Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms