Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLPPQ16740 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLPPQ16740 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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