Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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