Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms