Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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VPS72Q15906 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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