Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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