Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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