Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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