Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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PTPRKQ15262 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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