Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms