Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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