Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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