Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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