Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTPRJQ12913 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTPRJQ12913 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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