Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC10A2Q12908 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A2Q12908 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms