Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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