Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 949 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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