Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms