Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms