Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN7AQ01118 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms