Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms