Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms