Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCAMP43121 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCAMP43121 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCAMP43121 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCAMP43121 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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