Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTHFRP42898 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms