Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms