Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms