Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRZ1P23471 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms