Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ME2P23368 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ME2P23368 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ME2P23368 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms