Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms