Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms